MMP3

MMP3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1B3D, 1B8Y, 1BIW, 1BM6, 1BQO, 1C3I, 1C8T, 1CAQ, 1CIZ, 1CQR, 1D5J, 1D7X, 1D8F, 1D8M, 1G05, 1G49, 1G4K, 1HFS, 1HY7, 1OO9, 1QIA, 1QIC, 1SLM, 1SLN, 1UEA, 1UMS, 1UMT, 1USN, 2D1O, 2JNP, 2JT5, 2JT6, 2SRT, 2USN, 3OHL, 3OHO, 3USN, 4DPE, 4G9L, 4JA1
Ідентифікатори
Символи	MMP3, CHDS6, MMP-3, SL-1, STMY, STMY1, STR1, matrix metallopeptidase 3
Зовнішні ІД	OMIM: 185250 MGI: 97010 HomoloGene: 20545 GeneCards: MMP3
шифр КФ	3.4.24.17
Реагує на сполуку
cts-1027
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іонами цинку • GO:0070122 peptidase activity • endopeptidase activity • metalloendopeptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми • гідролазна активність • зв’язування з іоном металу • serine-type endopeptidase activity • metallopeptidase activity Клітинна компонента • GO:0005578 позаклітинний матрикс • extracellular region • міжклітинний простір Біологічний процес • collagen catabolic process • cellular response to nitric oxide • negative regulation of hydrogen peroxide metabolic process • деградація позаклітинного матриксу • протеоліз • positive regulation of protein oligomerization • positive regulation of oxidative stress-induced cell death • cytokine-mediated signaling pathway • response to hypoxia • regulation of cell migration • regulation of neuroinflammatory response • extracellular matrix organization • response to amyloid-beta Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4314	17392
Ensembl	ENSG00000149968	ENSMUSG00000043613
UniProt	P08254	P28862
RefSeq (мРНК)	NM_002422	NM_010809
RefSeq (білок)	NP_002413	NP_034939
Локус (UCSC)	Хр. 11: 102.84 – 102.84 Mb	Хр. 9: 7.45 – 7.46 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MMP3 (англ. Matrix metallopeptidase 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 477 амінокислот, а молекулярна маса — 53 977.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKSLPILLLL		CVAVCSAYPL		DGAARGEDTS		MNLVQKYLEN		YYDLKKDVKQ
FVRRKDSGPV		VKKIREMQKF		LGLEVTGKLD		SDTLEVMRKP		RCGVPDVGHF
RTFPGIPKWR		KTHLTYRIVN		YTPDLPKDAV		DSAVEKALKV		WEEVTPLTFS
RLYEGEADIM		ISFAVREHGD		FYPFDGPGNV		LAHAYAPGPG		INGDAHFDDD
EQWTKDTTGT		NLFLVAAHEI		GHSLGLFHSA		NTEALMYPLY		HSLTDLTRFR
LSQDDINGIQ		SLYGPPPDSP		ETPLVPTEPV		PPEPGTPANC		DPALSFDAVS
TLRGEILIFK		DRHFWRKSLR		KLEPELHLIS		SFWPSLPSGV		DAAYEVTSKD
LVFIFKGNQF		WAIRGNEVRA		GYPRGIHTLG		FPPTVRKIDA		AISDKEKNKT
YFFVEDKYWR		FDEKRNSMEP		GFPKQIAEDF		PGIDSKIDAV		FEEFGFFYFF
TGSSQLEFDP		NAKKVTHTLK		SNSWLNC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Nagase H., Enghild J.J., Suzuki K., Salvesen G. (1990). Stepwise activation mechanisms of the precursor of matrix metalloproteinase 3 (stromelysin) by proteinases and (4-aminophenyl)mercuric acetate. Biochemistry. 29: 5783—5789. PMID 2383557 doi:10.1021/bi00476a020
• Li Y.C., Zhang X., Melton R., Ganu V., Gonnella N.C. (1998). Solution structure of the catalytic domain of human stromelysin-1 complexed to a potent, nonpeptidic inhibitor. Biochemistry. 37: 14048—14056. PMID 9760240 doi:10.1021/bi981328w

Див. також

• Хромосома 11